Bioinformatyka

Treść:

Za pomocą narzędzia ClustalW, zaimplementowanego w serwisie EBI, należy wykonać multiple alignment dla takich samych zbiorów danych jak w zadaniach "MSA(nn) ręczne 1" i "MSA(aa) ręczne 1". Należy ustawić odpowiednie parametry inputowe aby porównanie było najbardziej podobne do wyżej wymienionych analiz.

Wyniki:

Należy zapisać pliki wynikowe (przede wszystkim plik *.aln) oraz wyjaśnić dlaczego wybrane takie ustawienia inputowe (oczywiście wyjaśnić należy te ustawienia, które mają konkretne uzasadnienie).

Wnioski:

Należy porównać alignmenty wykonane ręcznie z analizą automatyczną i opisać wyniki porównania, wyjaśniając zaistniałe rozbieżności.