W roku 1953 na olsztyńskiej WSR utworzono Katedrę Meteorologii i Klimatologii. Jej pierwszym kierownikiem był dr Eugeniusz Hohendorf. Od 1957 kierownictwo Katedry objęła doc dr Maria Mackiewicz, pełniąc je aż do 1970 roku. W tym czasie nastąpiła reorganizacja jednostek Uczelni i Katedra została włączona do Instytutu Uprawy Roli i Roślin w randze zakładu. Następnie już jako Zakład Agrometeorologii dawna katedra została usytuowana w strukturze Instytutu Ochrony Roślin. Lata 1982 - 1983 to okres pracy w Zakładzie doc. dr hab. Czesława Radomskiego (późniejszego profesora, autora doskonałego podręcznika z zakresu agrometeorologii, absolwenta olsztyńskiej Uczelni). Dnia 1.10.1998 roku, na mocy uchwały Senatu byłej ART w Olsztynie, dawny zakład został podniesiony do rangi katedry. Swoje piętno na działalności Zakładu odcisnął także prof. dr hab. Bonifacy Łykowski, który sprawował kierownictwo w latach 1988 - 1991, dojeżdżając z Warszawy. W międzyczasie, w sytuacjach, gdy brak było samodzielnego pracownika naukowego, funkcję p.o. kierownika spełniała z powodzeniem dr inż. Anna Nowicka (od 2002 roku na emeryturze).  Od 1 grudnia 1996 roku powrócono do historycznej nazwy Zakładu. W przeszłości działalność badawcza Zakładu dotyczyła sezonowej i przestrzennej zmienności warunków klimatycznych północno - wschodniej Polski oraz mikroklimatu terenów pagórkowatych. W okresie późniejszym zaangażowano się także w badania wpływu wybranych elementów pogodowych na wzrost, rozwój i plonowanie ważniejszych roślin uprawnych. Prowadząc obserwacje w trzech punktach pomiarowych (Bałcyny, Łężany i Tomaszkowo) udostępniano dane pogodowe dla innych jednostek Uczelni, a także zainteresowanych instytucji. Punkt pomiarowy w Łężanach uległ likwidacji z powodu zamknięcia tamtejszej stacji badawczej. Aktualnie realizujemy zadanie badawcze finansowane przez KBN pn. "Kliamtyczna waloryzacja rolniczej przestrzeni produkcyjnej Pojezierza Mazurskiego". W zakresie dydaktyki Katedra prowadzi zajęcia na Wydziale  Kształtowania Środowiska i Rolnictwa (studia magisterskie, zawodowe i zaoczne) z zakresu agrometeorologii oraz klimatologii. Od roku akademickiego 1997/98 oferta dydaktyczna została rozszerzona na nowe wydziały i kierunki studiów (meteorologia - na Wydziale Ochrony Środowiska i Rybactwa, agrometeorologia - na kierunku Ogrodnictwo oraz Zarządzanie i inżynieria produkcji, klimatologia na kierunku Architektura krajobrazu).