W katedrze prowadzone są badania podstawowe i stosowane. Badania z zakresu nauk podstawowych dotyczą przede wszystkim obszarów genetyki populacji, ewolucji organizmów i genotoksykologii, a także związanych z biotechnologiami stosowanymi w monitorowaniu jakości środowiska oraz w ochronie i restytucji populacji gatunków zagrożonych. W badaniach stosowanych kładziemy nacisk na rozwój technologii i metod biotechnologicznych stosowanych w ochronie środowiska w tym w oczyszczaniu ścieków o wysokim udziale trudnorozkładalnych związków organicznych, w remediacji gruntu, w usuwaniu metali ciężkich, utylizacji odpadów stałych i ograniczaniu ilości odcieków wysypiskowych.

Na wyposażeniu katedry znajdują się wiele instalacji technicznych i urządzeń pomiarowych.

Reaktory:

• Reaktory BIOFLO 110 i 3000 wykorzystywane do produkcji nowych materiałów z czystych kultur bakteryjnych czy badań nad efektywnością kumulacji polihydroksykwasów w osadzie czynnym;
• Bioreaktor w skali półtechnicznej wykorzystywany do kompostowania osadów ściekowych, w tym humifikacji materii organicznej oraz oceny ryzyka środowiskowego związanego z występowaniem metali ciężkich;
• Reaktory beztlenowe z pełnym wymieszaniem w skali półtechnicznej używane do badań nad wytwarzaniem biogazu z wykorzystaniem jako surowca biomasy roślinnej pochodzącej z upraw energetycznych;
• Reaktor typu air-lift wykorzystywany do badań sorpcji i desorpcji metali oraz barwników.

Aparatura analityczna i osprzęt:

• Chromatograf cieczowy z detektorami UV/VIS i FL: analiza WWA i bisfenolu A w próbkach środowiskowych;
• Chromatograf gazowy z detektorem masowym: analiza kwasów lotnych w wodach pofermentacyjnych i biopolimerów w hodowlach czystych oraz mieszanych;
• Analizator CHNS/O: analiza składu elementarnego w próbkach biomasy, odpadów komunalnych i pofermentacyjnych oraz kompostu;
• Spektrometr adsorpcji atomowej typu AA 280FS: analiza metali i metaloidów w próbkach środowiskowych;
• Analizatory TOC; analiza próbek ciekłych i stałych;
• Tensometr: pomiar napięcia powierzchniowego w surfaktantach i biosurfaktantach;
• Komory z systemem bezpieczeństwa o laminarnym przepływie powietrza;
• Aparaty Real-Time PCR (ABI 7500, Quant Studio 5) do kwantyfikacji DNA w czasie rzeczywistym;
• Bioanalizator 2100 wykorzystywany do analizy jakościowej kwasów nukleinowych i białek;
• Spektrofotometry UV-Vis;
• Ultrazamrażarki do głębokiego mrożenia próbek.