Instytut Słowiańszczyzny Wschodniej podpisał umowy o współpracy z wieloma uniwersytetami i ośrodkami naukowymi na Wschodzie, przede wszystkim w Rosji. W zakres współpracy wchodzi wymiana pracowników naukowych, naukowo-dydaktycznych i studentów, udział w konferencjach naukowych i seminariach, jak również wymiana doświadczeń dydaktycznych, omawianie aktualnych problemów naukowych i realizacja wspólnych projektów badawczych. Goście z zagranicy współredagują czasopisma i monografie wydawane w Instytucie Słowiańszczyzny Wschodniej, recenzują artykuły i rozdziały książek.
БАЛТИЙСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ ИММАНУИЛА КАНТА [BAŁTYCKI FEDERALNY UNIWERSYTET IMIENIA IMMANUELA KANTA]
ЦЕНТР ПО ИЗУЧЕНИЮ ЦЕРКОВНОСЛАВЯНСКОГО ЯЗЫКА ИНСТИТУТА РУССКОГО ЯЗЫКА ИМЕНИ В.В. ВИНОГРАДОВА РАН [CENTRUM JĘZYKA CERKIEWNOSŁOWIAŃSKIEGO INSTYTUTU JĘZYKA ROSYJSKIEGO IMIENIA W.W. WINOGRADOWA ROSYJSKIEJ AKADEMII NAUK]
ДОМ РУССКОГО ЗАРУБЕЖЬЯ [DOM ROSYJSKIEJ ZAGRANICY]
СЫКТЫВКАРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ ПИТИРИМА СОРОКИНА [SYKTYWKARSKI PAŃSTWOWY UNIWERSYTET IMIENIA PITIRIMA SOROKINA]
СЕВЕРНЫЙ (АРКТИЧЕСКИЙ) ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В. ЛОМОНОСОВА [PÓŁNOCNY (ARKTYCZNY) FEDERALNY UNIWERSYTET IMIENIA M.W. ŁOMONOSOWA]
БАШКИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ПЕДАГОГИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. М. АКМУЛЛЫ [BASZKIRSKI PAŃSTWOWY PEDAGOGICZNY UNIWERSYTET IM. M. AKMUŁŁY]
УРАЛЬСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ ПЕРВОГО ПРЕЗИДЕНТА РОССИИ Б.Н. ЕЛЬЦИНА [URALSKI FEDERALNY UNIWERSYTET IMIENIA PIERWSZEGO PREZYDENTA ROSJI B.N. JELCYNA]
НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ НИЖЕГОРОДСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМ. Н.И. ЛОБАЧЕВСКОГО [NARODOWY BADAWCZY NIŻEGORODSKI PAŃSTWOWY UNIWERSYTET IM. N.I. ŁOBACZEWSKIEGO]
ПЕРМСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ПОЛИТЕХНИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ [PERMSKI NARODOWY BADAWCZY UNIWERSYTET POLITECHNICZNY]
КАЗАХСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ПЕДАГОГИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ АБАЯ [KAZACHSKI NARODOWY PEDAGOGICZNY UNIWERSYTET IMIENIA ABAJA]
ПЯТИГОРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ [PIATIGORSKI PAŃSTWOWY UNIWERSYTET]
ОШСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ [PAŃSTWOWY UNIWERSYTET W OSZ (KIRGIZJA)]
W 2018 roku ISW nawiąże współpracę z akademiami nauk, stowarzyszeniami i uniwersytetami z Litwy, Łotwy.
