KEGG Brite

KEGG HOME

WPROWADZENIE

PRZEGLĽD

STATYSTYKA

KEGG IDENTIFIERS

KEGG FTP

KEGG TOOLS

KONTAKT
Kontakt
KEGG BRITE

KEGG Brite jest kolekcją hierarchicznych klasyfikacji, reprezentującą wiedzę w różnych aspektach systemów biologicznych. W kontraście do KEGG Pathway, który ogranicza się do interakcji molekularnych i reakcji, KEGG Brite łączy wiele różnych typów zależności. Na przykład mapowanie genomowych i molekularnych danych do KEGG Brite (przez system KO) uzupełnia mapowanie KEGG Pathway o większy ład i funkcjonalność
Dla przykładu rozpatrzmy wyszukiwanie dla enzymu: urease
  • Otrzymujemy usystematyzowane wyniki wyszukiwania dla słowa urease kolejno dla ortologii (KO): metabolizmu (z uwzględnieniem podziału na metabolizm nukleotydów, aminokwasów itd.), informacji procesów genetycznych, chorób ludzkich; dla enzymów; dla ligandów enzymów. urease
  • Dalej, poszukując, na przykład, informacji na temat podjednostki alfa, klikamy w KO 1428, otrzymując dane w systemie KO. KO1428
  • Poszukując informacji ogólnej o ureazie klikamy w numer EC. EC3.5.1.5

Autorzy:

Zbigniew Jakub Bidas,Karolina Osowiecka,Jarosław Piotrowski,Paweł Podliński,Piotr Tyszer