spacer
spacer
EBI 2Can Tutorials Analiza nukleotydowa

2Can Support Portal - Nucleotide Analysis

ClustalW2 wielokrotne dopasowanie sekwencji <<< 2/6 >>>

Uruchomienie dopasowania ClustalW


Będziemy rozważyć dostosowanie kilku tropomiozyn sekwencji, reprezentowana przez przystąpienie numery poniżej.		 
BF056441 BE8487196 BF022813 BF452255 BG089808 BG147728 BI817778 AF186109 
AF186110 AF310722  AF362886 AF362887 AF087679 SSAJ803 SSAJ804

Sekwencja dla tych nukleotydów jest dostępna tutaj. One są napisane w następującym formacie:

 
>sekwencja1
ATGAAGGATGAGGAGAAGATGGAGATTCAGGAGATGCAGCTCAAAGAGGCCAAGCACATT
ATGAAGGATGAGGAGAAGATGGAGATTCAGGAGATGCAGCTCAAAGAGGCCAAGCACATT
>sekwencja2
GCAGACGACGCANAGGATCGCGCGCAAGGCCTGCAGCGCGAACTGGATGGCGAGCTCTAG
GCGGACGAGGCAGAGGATCGCGCGCAGGGCCTGCAGCGGGAGCTGGACGGCGAGCGCGAG
>sekwencja3
GCGGAAGAGGCTGACCGCAAATACGAGGAGGTAGCTCGTAAGCTGGTCATCCTGGAGGGT
GCGGACGAGGCCGAAGAGCGGGCCGAGATCCTGCAGAGGGAGGTGGACGCCGAGAGGCAG

Rozważmy następująceClustalW założenia formularza:

Go to the main EBI website
N.B. To narzędzie programistyczne może otrzymywać dostęp jak serwis sieci.


  • Wielokrotne dopasownaie sekwencji były załadowane w formacie FASTA, który składa się z jednej lini header starting with a ">" symbol, followed by the sequence name/description. The sequence is then entered on new line(s). Click here to view the input

  • Tytuł dopasowania zmieniony został do mhc wyrównania.

  • Inne wybory były pozostawiane na "brak ".

Następnie będziemy patrzyli na wyniki porównywania ClustalW >>>


<<< Poprzednia || Start lekcji || Następna >>>

spacer
spacer